La struttura a supporto delle funzioni esercitate dal Commissario straordinario è composta da persone che rimangono comunque dipendenti dell'Amministrazione di appartenenza, per la quale continuano a svolgere le proprie mansioni e al cui carico rimangono gli oneri per il personale.

La struttura commissariale è supportata da un'unità di progetto composta da personale appartenente alle diverse amministrazioni pubbliche interessate all'attività di messa in sicurezza e ripristino dell'area del SIN di Trieste.

Si tratta in entrambi i casi per la quasi totalità di dipendenti della Regione Autonoma Friuli Venezia Giulia.